När NGP nu driftsätts och regionerna följt sina rutiner kring analys av NGP som system för lagring av hälsodata kommer genomikdata (och kopplad metadata som t ex identitiet, frågeställning, fenotypisk information och data kring prov och analys) från klinisk diagnostik att allt efter att data genereras lagras i respektive regions del av NGP. Den av denna data som initialt kommer att delas är den för vilken det finns etikgodkännande inom ramen för en vetenskaplig studie att dela. Den märkning av datan som gör delning möjlig utförs av den region där dataägaren befinner sig.
Inom ett samarbete med Folhälsomyndigheten utarbetas samtidigt tekniska lösningar för delning av genomikdata enlig Smittskyddslagen.
Slutligen kommer så kallade aggregerade data, resultat från antalsberäkningar inom varje regions data, att delas. Dessa är inte längre kopplade till en enskild person och utgör alltså inte känsliga hälsodata.
NGP är också förberedd för att i ett nästa steg dela data för primäranvändning av data när de legala förutsättningarna för detta öppnas, liksom att vara en kontaktpunkt för svensk klinisk genomikdata inom den europeiska datadelning som planeras inom European Health Data Space och där beslut förväntas februari 2025.